Terran:
Ex-coronel Arcturus Mengsk - Líder de Los Hijos de Korhal. Actual emperador del Dominio Terran
Comandante Jim Raynor - Era comandante - comisario colonial en Mar Sara, hasta que se une a la rebelión contra la Confederación.
Almirante Gerard DuGalle - Líder de la expedición del Directorio de la unión Terrestre (DUT).
Vice-Almirante Alexei Stukov - Segundo al mando de la expedición del DUT.
Teniente Samir Duran - Ex-Confederado que lucha contra el Dominio Terran, aliado al DUT.
General Edmund Duke - Veterano general de la Confederación.
Teniente Sarah Kerrigan - Segunda al mando de los Hijos de Korhal.
Zerg:
Sarah Kerrigan (Infectada por los Zerg) - La nueva creación de la Supermente. Solía ser Sarah Kerrigan, pero ahora es la Reina de los Zerg o la reina de espadas
La Supermente - Líder absoluto del Enjambre.
Cerebrado Daggoth - Aparentemente, el Cerebrado más poderoso e influyente.
Cerebrado Zasz - Maestro de la Cría Garm.
Samir Duran (Infectado por los Zerg) - Aliado y sirviente de Kerrigan. Aunque este infestado, en realidad sirve a una raza más poderosa.
Cazador Asesino - Hidralisco superior, con más poder de ataque, mayor puntaje de vida y con todas las mejoras del Hidralisco.
El Devorador - Zergling superior, con más ataque, más puntos de vida y con todas las mejoras.
Torrasque - Es un ultralisco creado por Kerrigan y la Supermente, el es muy fuerte y su ataque es el doble que de un Ultralisco normal.
Protoss:
Alto Templario Tassadar - Antiguo Ejecutor de la flota Expedicionaria Protoss.
Judicator Aldaris - Agente del Cónclave enviado para aconsejar al Ejecutor.
Pretor Fénix - Poderoso héroe Fanático (Zealot), y buen amigo de Tassadar. Muere en cierto momento del juego y retorna como Dragón.
Pretor Artanis - El Protoss más joven en lograr alcanzar este rango. Era el ejecutor manejado por el jugador en el StarCraft original.
Zeratul - Prelado de los Templarios Tétricos.
Raszagal - Matriarca de los Templarios Tétricos.
Comandante Jim Raynor - Después de separarse de los Hijos de Korhal se une a la causa de los Protoss.